遺傳多樣性研究意義是不了解種內(nèi)遺傳變異的大小時(shí)空分布及其與環(huán)境條件的關(guān)系，我們就無法采取科學(xué)有效的措施來保護(hù)人類賴以生存的遺傳資源基因，來挽救瀕于絕滅的物種，保護(hù)受到威脅的物種。

對于我們所不了解的對象，我們是無法保護(hù)的。對珍稀瀕危物種保護(hù)方針和措施的制定，如采樣策略遷地或就地保護(hù)的選樣等等都有賴于我們對物種遺傳多樣性的認(rèn)識。

對遺傳多樣性的認(rèn)識是生物各分支學(xué)科重要的背景資料。古老的分類學(xué)或系統(tǒng)學(xué)幾百年來都在不懈地探索描述和解釋生物界的多樣性，并試圖建立個(gè)能反映自然或系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的階層系統(tǒng)，以及建立一個(gè)便利而實(shí)用的資料（信息）存取或查尋系統(tǒng)。對遺傳多樣性的研究無疑有助于人們更清楚地認(rèn)識生物多樣性的起源和進(jìn)化，尤其能加深人們對微觀進(jìn)化的認(rèn)識，為動(dòng)植物的分類進(jìn)化研究提供有益的資料，進(jìn)而為動(dòng)植物育種和遺傳改良奠定基礎(chǔ)。