新疆有兩所211工程大學，故新疆最好的大學為新疆大學和石河子大學。

新疆大學，簡稱“新大”，位于新疆維吾爾自治區(qū)首府烏魯木齊，是1978年確定的全國重點大學，國家“211工程”建設高校、國家西部大開發(fā)重點建設高校、中西部高?；A(chǔ)能力建設工程高校、”卓越工程師教育培養(yǎng)計劃“、”卓越法律人才教育培養(yǎng)計劃“、教育部與新疆維吾爾自治區(qū)人民政府共建高校，“中西部高校聯(lián)盟”成員。

石河子大學，簡稱“石大”，位于被譽為戈壁明珠的新疆石河子市，是國家 “211工程”重點大學，學?，F(xiàn)有經(jīng)濟、法、教育、文、歷史、理、工、農(nóng)、醫(yī)、管理、藝術(shù)等11大學科門類。擁有5個一級學科博士學位授權(quán)點，涵蓋25個二級學科博士學位授權(quán)點；23個一級學科碩士學位授權(quán)點，144個相關(guān)二級學科碩士學位授權(quán)點；9種碩士專業(yè)學位授權(quán)類別，84個本科專業(yè)，4個博士后流動站。