結(jié)構(gòu)基因組學(xué)是以全基因組測(cè)序?yàn)槟繕?biāo)，確定基因組的組織結(jié)構(gòu)、基因組成及基因定位的基因組學(xué)的一個(gè)分支。它代表基因組分析的早期階段，以建立具有高分辨率的生物體基因組的遺傳圖譜、物理圖譜及轉(zhuǎn)錄圖譜為主要內(nèi)容。以及研究蛋白質(zhì)組成和結(jié)構(gòu)的學(xué)科。

功能基因組學(xué):運(yùn)用遺傳技術(shù)，通過(guò)識(shí)別某個(gè)基因在一個(gè)或多個(gè)生物模型中的作用來(lái)認(rèn)識(shí)新發(fā)現(xiàn)基因的功能。功能基因組用功能不明的分離基因作為起始點(diǎn)，然后選擇具有該同源基因的生物模型。這一生物模型可以是簡(jiǎn)單的酵母細(xì)胞或復(fù)雜的線蟲(chóng)甚至老鼠?；虮贿x擇性的用多種遺傳技術(shù)滅活，在此生物體上選擇性去除的效果被確定。通過(guò)這種方法去除基因，它對(duì)生物功能的貢獻(xiàn)就能夠被識(shí)別。功能基因組在評(píng)估和檢測(cè)新藥時(shí)十分有用。在另一種方法中，一整套基因被系統(tǒng)地滅活，人們就可以檢測(cè)其對(duì)特定細(xì)胞功能的影響。這里，一個(gè)新的基因和其功能就同時(shí)被識(shí)別了。