我國新型舉國體制是科技創(chuàng)新領域，本質上，舉國體制是一項組織體系的制度安排，屬于政治體制，而且是社會主義制度的獨特優(yōu)勢所在。而市場經濟、計劃經濟，則是對經濟生產各種資源要素的優(yōu)化配置方式，屬于機制模式。兩者一為體制，一為機制，并不存在直接對應關系，更不能簡單畫等號，認為舉國體制就是計劃經濟。這是把體制和機制混淆了，錯誤地認為兩者之間存在等同關系。

舉國體制有其審慎性，舉國體制涉及到政策如何由上而下貫徹、落實，既不能打折扣，又要因地制宜，這就有工作方法的問題。中國共產黨最講究工作方法，注重調查研究、實事求是，強調先試點，取得經驗后再由點到面，波浪式推廣。

舉國體制涉及到由誰來組織、領導以及發(fā)展的方向、目的等帶有根本性的問題。將中國由農業(yè)文明轉變?yōu)楣I(yè)文明，將全中國組織、動員起來的領導者是中國共產黨。