三方協(xié)議和兩方協(xié)議的區(qū)別是合同本質(zhì)不同，三方協(xié)議書(shū)，三方是指畢業(yè)生、用人單位和畢業(yè)生所在院校。三方協(xié)議是《全國(guó)普通高等學(xué)校畢業(yè)生就業(yè)協(xié)議書(shū)》的簡(jiǎn)稱(chēng)，它是明確三方在畢業(yè)生就業(yè)工作中的權(quán)利和義務(wù)的書(shū)面表現(xiàn)形式，能解決應(yīng)屆畢業(yè)生戶(hù)籍、檔案、保險(xiǎn)、公積金等一系列相關(guān)問(wèn)題。

協(xié)議在畢業(yè)生到單位報(bào)到、用人單位正式接收后自行終止。雙方協(xié)議簽訂的主體是兩方，不涉及到第三方，只要雙方意思表示真實(shí)即可。