國(guó)務(wù)院組成部門和直屬機(jī)構(gòu)區(qū)別是地位不同,國(guó)務(wù)院下屬組成部門和直屬單位,直屬單位的地位略低于組成部門,地方各級(jí)政府下屬工作部門與直屬單位,與國(guó)務(wù)院的組成部門與直屬單位基本上存在對(duì)應(yīng)的關(guān)系。
人事任命方式不同,國(guó)務(wù)院直屬機(jī)構(gòu)指的是各總局、總署,國(guó)務(wù)院有權(quán)根據(jù)需要自行決定這些部門的設(shè)立及其首長(zhǎng)人事任免事務(wù)等事項(xiàng),而無需經(jīng)過人大及其常委會(huì)。這些部門不是國(guó)務(wù)院的組成部門,因此它們的的行政首長(zhǎng),除有特別需要時(shí),不能參加國(guó)務(wù)院會(huì)議。這些部門中,帶“總”字的部門的首長(zhǎng)為正部級(jí),其余為副部級(jí)。